Ručni CIP i automatski CIP su dvije uobičajene metode čišćenja opreme za čišćenje. Proces ručnog CIP čišćenja zahtijeva ručnu kontrolu, dok automatski CIP koristi automatizirani sistem za postizanje čišćenja.
Ručni CIP zahtijeva od osoblja da ručno kontrolira proces čišćenja, uključujući otvaranje i zatvaranje ventila, pumpanje sredstava za čišćenje i ispuštanje kanalizacije. Ručni rad zahtijeva od operatera određeno tehničko znanje i iskustvo, te mora striktno slijediti radne korake i raspored. Ručne operacije CIP čišćenja su velike i složene, a nepravilan rad može lako uzrokovati nepotpuno čišćenje ili oštećenje opreme.
Nasuprot tome, automatsko CIP čišćenje ima veći stepen automatizacije i inteligencije, a njegov radni proces automatski kontroliše kompjuterski program. Kontrolni sistem automatskog CIP-a može automatski podesiti vrijeme i temperaturu pranja, te automatski promijeniti vrstu, koncentraciju i protok tekućine za pranje. Štaviše, automatski CIP ima i funkcije prikupljanja i analize podataka, koje mogu pratiti učinak čišćenja u realnom vremenu. Automatski CIP je jednostavan, praktičan i brz za rad, što ne samo da smanjuje rizik od pogrešnog rada, već i poboljšava efikasnost i kvalitet čišćenja i smanjuje troškove čišćenja.
Općenito, ručni CIP i automatski CIP imaju svoje prednosti i nedostatke, ali s napretkom tehnologije, automatski CIP je postao glavna konfiguracija opreme za čišćenje
